Si les composés ciblés sont polaires, la cause principale de la faible récupération sera l'efficacité de l'extraction. Les facteurs pertinents sont la force des solvants d'élution, la quantité de sorbant dans la colonne, le volume de l'échantillon et le pH de la solution d'échantillon. Si les composés ciblés sont de faible polarité (comme les HAP, les PCB, les hydrocarbures), les principales causes de faible récupération sont l'adsorption par le récipient et la tubulure et la perte par évaporation. Les facteurs pertinents sont l'inertie des composants mouillants et de la colonne et la compatibilité des solvants avec les composés ciblés.