Le collecteur de fraction permet d’isoler une molécule d’un mélange complexe de molécules organiques. Cette molécule piégée va ensuite être caractérisée par spectrométrie de masse et par résonance magnétique nucléaire. Le collecteur de fraction permet aussi un enrichissement, après plusieurs injections, d’une molécule en très faible quantité. Cet enrichissement va faciliter la caractérisation de cette molécule puisque beaucoup plus concentrée.